1. בחירת שיטות הקרנה שונות
הקרנת אינפרא אדום משמשת בעיקר לטיפול מקומי. במקרים בודדים, כגון קרינה אולטרה סגולה של כל הגוף בילדים, ניתן להשתמש בו גם יחד עם קרינת אינפרא אדום להקרנת כל הגוף. אם ההקרנה המקומית דורשת אפקט חום עמוק, יש להעדיף מנורות ליבון (כלומר, מנורות שמש). ניתן להשתמש ברחצה קלה מקומית לטיפול בדלקת מפרקים שגרונית כרונית; רחצה קלה מערכתית יכולה לשמש לטיפול בדלקת עצב היקפית מרובת.
2. מנת חשיפה
גודל מינון הטיפול באינפרא אדום נקבע בעיקר על פי מאפיינים ומיקום הנגעים, גיל המטופל ומצבו התפקודי של הגוף. בהקרנה בקרני אינפרא אדום יש למטופל תחושה חמימה נוחה, והעור עשוי להיראות אדמדם ואדום אחיד. אם מופיעה אריתמה דמוית שיש, זה ביטוי של התחממות יתר. טמפרטורת העור לא תעלה על 45 מעלות, אחרת היא עלולה לגרום לכוויות.